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CRISPR Detect : Single Cell CRISPR Screening at Unprecedented Scale

CRISPR Detect : Single Cell CRISPR Screening at Unprecedented Scale

Parse Biosciences

개별 세포에 포함 된 전장 전사체와 guide RNA를 모두 검출할 수 있습니다. CRISPR Detect 제품은 단일세포 CRISPR screening에 대한 매우 정교한 접근 방법으로, CRISPR Detect 제품과 Evercode Whole Transcriptome 제품을 같이 사용 하여 sgRNA(single guide RNA)의 서열을 enrich하여 얻을 수 있습니다. 시퀀싱 이후 Parse사에서 제공하는 pipeline을 사용하여 sgRNAs와 이와 관련된 전장 전사체를 분석 할 수 있습니다

제품특징

 

제품 특징

단일세포 pooled CRISPR screen는 교란이 이루어진 각각의 유전자와 유전자 발현 profile을 연결하여 복잡한 형태의 표현형을 분석을 가능하게 하며, 신약 개발의 표적 검증, 치료 후 상반된 반응 차이의 이해 및 세포 분화와 관련된 경로 발견을 위해 사용될 수 있습니다. 

이 접근법은 수백개 이상의 가이드 RNAs(sgRNA) 라이브러리를 위한 충분한 수의 세포를 처리할 수 있는지에 대한 실행 가능성으로 인해 폭 넓은 사용에 제약이 있었지만, Parse사의 CRISPR Detect 제품은 Evercode 기술의 확장성을 단일세포 CRISPR screen 실험에 도입하여 실용적이고 폭 넓은 게놈 연구가 가능하도록 만들어줍니다. 

 

▶Feature 

 |    넓은 범위의 게놈 screen 가능

한번의 실험으로 최대 백만 개의 세포에서 대규모  guide RNA- library를 스크리닝합니다.

 

 |    하나의sgRNA로 많은 세포를 검출

효율적인 enrichment를 통해 더 많은 세포들에서 sgRNA를 확실하게 감지합니다. 

 

 |    더 많은 sample 분석

Evercode WT Mega 제품을 사용 한 단일실험으로 최대 96개의 샘플 또는 처리를 합니다.

 

 

단일세포 pooled CRISPR screenig은 개별 CRISPR 교란을 유전자 발현 특징과 연결함으로써 복잡한 표현형을 분석할 수 있으며 발생생물학, 약물 개발 그리고 치료 반응에 대한 이해에 적용되었습니다. 하지만 기존의 접근 방식은 대규모 단일 가이드 RNA(sgRNA) 라이브러리를 위한 충분한 수의 세포를 처리할 수 있는지에 대한 실행 가능성으로 인해 넓은 범위에서의 적용이 제한되어져 왔습니다.

이에 Parse사의 CRISPR Detect 제품은 단일세포 pooled CRISPR screen실험에 Evercode 기술의 확장성을 접목시킴으로써 각 실험에서 100s~10000s개의 교란을 검출할 수 있어 넓은 범위의 유전자연구가 가능합니다.





Scalability of Evercode Applied to CRISPR Screening
CROP-seq vectors에서 발현된 전체 전사체 및 쌍을 이루는 sgRNA를 분석합니다. 

Analyze More Perturbations in Fewer Runs
CRISPR Detect 제품과 Evercode 기술을 사용하면 더 적은 수의 실험을 통해 100s~10000s의 sgRNA를 쉽게 확장하여 분석할 수 있습니다.




Detect More Cells with Just One Guide
단 하나의 가이드로 더 많은 세포를 감지할 수 있어 시퀀싱 데이터와 분석 퀄리티를 높일 수 있습니다.

▶ THE CRISPR DETECT WORKFLOW






품목정보

품번 품명 가격
CRS1010 CRISPR Detect | Guide RNA enrichment sufficient for 16 sublibraries 견적문의
ECW02155 Evercode WT Mega v2 | Up to 1,000,000 cells or nuclei and 96 samples 견적문의
ECW02135 Evercode WT v2 | Up to 100,000 cells or nuclei and 48 samples 견적문의
ECF2001 Evercode Cell Fixation v2 | Up to 4 samples 견적문의